目前，按照“資源整合、功能集成、政策疊加、優(yōu)勢互補”的原則，昆明空港經濟區(qū)、昆明出口加工區(qū)、王家營陸港正積極對接，全力推進綜合保稅區(qū)建設。業(yè)內人士普遍認為，這是昆明物流業(yè)的一次大的整合和飛躍，綜合保稅區(qū)建成后將有效提升昆明物流業(yè)的競爭力。 
　　早在2008年就有專家提出建設保稅港區(qū)的大膽設想。中國區(qū)域經濟學會常務理事、云南財經大學經濟研究院原院長李淳燕曾表示：“建設昆明保稅港區(qū)是提高云南開放度、建設中國—東盟自由貿易區(qū)、建設國際化昆明的最佳選擇，有利于把云南的區(qū)位優(yōu)勢轉化為經濟優(yōu)勢。” 
　　此后，在《昆明市“十二五”現代物流業(yè)發(fā)展規(guī)劃》中，昆明市在關于建設國際空港物流基地的部分提出，要建設含保稅區(qū)、倉儲區(qū)、郵件速遞分揀區(qū)、海鮮及水產品服務區(qū)、流通區(qū)，將為昆明航空貨物運輸提供更加便捷的通道，使更多外向型貿易得以通過“保稅”的物流形式完成。至此，“保稅”物流作為一個強有力的物流支撐形勢與空港建設正式“牽手”。 
　　所謂保稅物流，特指在海關監(jiān)管區(qū)域內，包括保稅區(qū)、保稅倉、海關監(jiān)管倉等，從事倉儲、配送、運輸、流通加工、裝卸搬運、物流信息、方案設計等相關業(yè)務。在“保稅”狀態(tài)下，企業(yè)享受海關實行的“境內關外”制度以及其他稅收、外匯、通關方面的特殊政策。 
　　在鄰近空港經濟區(qū)的昆明出口加工區(qū)內，相關物流企業(yè)已經開展保稅物流業(yè)務。就在近期，昆明出口加工區(qū)內云南領航物流有限公司已通過保稅物流的方式，為云南昆鋼國際貿易有限公司運輸了一臺電子束熔化爐，為貨主減輕了近1000萬元的關稅資金壓力。這樣的實惠，將惠及更多企業(yè)。 
　　2010年，昆明市傳出消息，擬用空港經濟區(qū)的臨空經濟，以及王家營鐵路物流片區(qū)的陸港優(yōu)勢，將昆明出口加工區(qū)、空港經濟區(qū)、王家營物流片區(qū)一并整合為昆明綜合保稅區(qū)。這預示著，“保稅”物流將對做大做強“空港”、“陸港”，擴大對外開放發(fā)揮更大的作用。 
　　根據規(guī)劃，昆明綜合保稅區(qū)選址于昆明長水國際機場東南側，北臨昆明長水國際機場南工作區(qū)，南臨新320國道，西臨新建水廠，東臨規(guī)劃空港3號路；總占地面積約2.13平方公里，采用封閉圍網進行管理；內設港口輔助作業(yè)區(qū)、海關檢查區(qū)、綜合管理服務區(qū)、保稅倉庫區(qū)、出口加工區(qū)和普通倉儲區(qū)，并設有獨立的物流專用通道。